儲液器中的流動相被高壓泵打入檢測系統，樣品溶液經進樣器進入流動相，被流動相載入色譜柱（固定相）內，由于樣本溶液中的各組分在兩相中具有不同的分配系數，在兩相中作相對運動時，經過反復多次的“吸附-解吸”的分配過程，各組分在移動速度上產生較大的差別，被分離成單個組分依次從柱內流出，通過檢測器時，樣本濃度被轉換成電信號傳送到記錄儀，數據以圖譜形式輸出檢測結果。

高效液相色譜儀方便易用的流量和壓力校正功能，確保儀器的高精度和穩定性；采用靜態電機控制電路，實現電機控制信號的自動反饋跟蹤功能，有效提高電機控制精度，確保了泵的可靠性及穩定性；通用樣品池設計，微量與常量池之間更換方便。

高效液相色譜法適于分析沸點高、相對分子質量大，受熱易分解的不穩定有機化合物、生物活性物質以及多種天然產物。局限性：

1.離效液相色譜法中需使用多種溶劑，其成本比氣相色譜法髙，且易引起環境污染；當進行梯度淋洗時，操作比氣相色譜的程序升溫操作復雜。

2.高效液相色譜法中缺少像氣相色譜法中使用的熱導池檢測器，氫火焰離子化檢測器那樣的通用型檢測器。

3.髙效液相色譜法不能替代氣相色譜法去完成要求柱效達10萬塊理論塔板數以上的，組成復雜的石油樣品分析。也不能替代中、常壓柱色譜法去分析受壓易分解、變性的生物活性樣品。